A Capitania de São Tomé, também conhecida como Capitania de Paraíba do Sul, foi criada em 1536 como uma das quinze parcelas do território brasileiro entregues pelo rei de Portugal, Dom João III de Portugal, a donatários em regime de hereditariedade. A capitania foi doada a Pero de Góis e ia desde as atuais cidades de Cachoeiro de Itapemirim (Espírito Santo) a Macaé (Rio de Janeiro).
O donatário fundou uma vila e começou um incipiente cultivo de cana-de-açúcar, mas a colonização foi muito hostilizada pelas populações autóctones. O território ficaria praticamente abandonado até que em 1619, a capitania foi foi renunciada a favor da Coroa portuguesa e posteriormente absorvida pela Capitania do Rio de Janeiro.